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这种基因的变异会导致疾病吗?

基因中的哪些变化会导致疾病?

是否可以采取措施改善这种基因风险患者的预后?

该基因或基因组区域的复制丢失或获得会导致疾病吗?

体细胞癌症临床领域工作组策划与以下疾病特定工作队的不同癌症类型相关的基因组异常的临床意义-儿科癌症，胰腺癌，肺癌和泌尿生殖系统癌症

基线注释侧重于以结构化和标准化的方式注释生物医学文献中的证据，从而支持我们的专家小组、工作组和管理过程。

目的是确定那些人类基因，当显著改变时，会带来严重疾病的高风险，如果风险已知，可以预防或减轻。

ClinGen祖先和多样性工作组(ADWG)致力于确保基因组药物对每个人都有效，无论种族、民族或祖先背景如何。

ClinGen社区策展工作小组(C3)的任务是与潜在的ClinGen志愿者进行接触、识别和沟通，并促进志愿者在策展工作中的组织和安置。

在不同的临床领域对基因/表型进行临床有效性和临床特征的筛选

ClinGen复杂疾病工作组是多基因和综合风险评分建模方面的多学科专家组，具有流行病学、统计学、实施科学和各种临床领域的专业知识。复杂疾病工作组的工作重点是为报告和评估多基因和综合风险评分提供标准。

为细胞基因组拷贝数变异的临床解释建立一个系统的框架。

数据获取、保护和保密(DAPC)工作组是一个多学科的学者和专业人员团队，他们在临床管理、数据共享政策、道德和法律框架、软件开发和临床遗传学实践方面具有专长。

通过在团队和工作流程之间使用统一的数据标准开发软件产品的集成系统来支持ClinGen的目标。

评估支持或驳斥单个基因和基因组区域剂量敏感性的证据。

旨在通过教育、培训、外联和资源开发，促进社区参与ClinGen项目的各个方面。

确保ClinGen资源设计为通过电子健康记录和相关系统对提供者和患者开放。

科学和技术顾问支持克林根的主要目标和整体使命。

开发基于证据的方法评估基因-疾病相关性，以支持ClinGen项目的基因管理活动。金宝搏188bet

汇集和分割工作组为定义和细化疾病实体提供指导，用于基因疾病分类，并与疾病分类学和本体学当局合作，协调疾病实体分类和分类。

ACMG/AMP解释序列变体指南的改进和增强。

提供关于ClinGen资源的活动和方向的监督、指导和执行决策。

该专家组的任务是利用针对脂肪酸氧化障碍的改进的ACMG变体分类规则，筛选编码超长链酰基辅酶a脱氢酶(VLCAD)的ACADVL变体。VLCAD是一种线粒体酶，催化长链脂肪酸β-氧化的第一步(Aoyama et al.， 1995)。ACADVL的常染色体隐性病理变异体引起VLCAD缺陷(VLCADD;OMIM #201475) (Strauss等人，1995)。由于这种紊乱的脂肪酸代谢，这些患者在血浆中积累了高水平的长链酰基肉碱衍生物(C14:1)。VLCAD缺乏症的临床表现广泛，包括:严重新生儿表现为心肌病和高死亡率;儿童起病以低血糖血症伴肝功能障碍;或作为成人发病，运动/禁食诱发肌病，表现为横纹肌溶解和肌红蛋白尿。ACADVL等位基因往往具有基因型/表型相关性(Andresen et al.， 1999)。VLCADD的发病率现在估计为1:3万至1:10万出生(McHugh等人，2011年)。 Members of the current expert panel are experienced in different aspects of VLCAD deficiency and metabolic disease, including direct patient care, biochemical and molecular laboratory testing, and variant classification/curation.

脑畸形包括一组遗传性发育性脑障碍，在儿童时期表现为智力残疾、癫痫和其他神经功能特征，造成大量发病率、死亡率和卫生保健费用。我们现在知道，许多脑畸形病例是由罕见的遗传性原因造成的;在其他情况下，它们产生于配子或受精卵后阶段的从头开始或体细胞突变事件。在所有情况下，建立正确的基因组诊断是正确临床管理的基石。

BrS是一种遗传性心律失常，易使患者发生心源性猝死。目前在临床基因检测小组中发现的导致BrS的基因超过20个。

先天性肌病基因鉴定专家组的目的是鉴定与先天性肌病相关基因的疾病相关性的有效性。

癫痫基因管理专家小组专注于确定致病变异明确导致癫痫表型的基因。基因-疾金博宝188BET网址病有效性管理过程包括描述支持特定基因-疾病关系的证据水平的6个分类类别:明确的、强烈的、适度的、有限的、有争议的、反驳的。

家族性高胆固醇血症是一种脂代谢常染色体疾病。患者自出生起LDL值就增加，心血管风险增加，因此早期诊断和治疗对改善预后至关重要。与FH相关的主要致病基因有三个:LDLR、APOB和PCSK9。对这些基因中任何一种致病变异的鉴定可提供明确的诊断。

普通基因管理专家小组审查那些不属于ClinGen其他基因管理专家小组职权范围的基因管理。

遗传性听力损失基因管理专家小组致力于确定致病性变异导致听力损失的基因。基因-疾金博宝188BET网址病有效性管理过程包括描述支持特定基因-疾病关系的证据水平的6个分类类别:明确的、强烈的、适度的、有限的、有争议的、反驳的。

听力损失专家小组旨在明确现有的ACMG关于听力损失基因变体分类的指南，并审查专家分类的变体，包括解决ClinVar中现有变体分类的差异，优先排序最常见的与听力损失相关的基因和变体。

目的是定义ACMG/AMP规则的基因规范，用于非brca1 /2、非mmr DNA修复相关的乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌易感基因(ATM、BARD1、BRIP1、CHEK2、RAD51C、RAD51D和PALB2)的变异分类。这些基因都涉及DNA损伤后的同源重组DNA修复和/或细胞周期调控，在评估患者乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌风险增加的突变时，经常使用多基因临床遗传性癌症检测小组同时进行检测。

主动脉病变组使用ClinGen基因:疾病临床有效性框架来评估基因涉及遗传性胸主动脉瘤和夹层的证据强度。该小组由5个不同国家的临床领域专家组成，他们来自对遗传主动脉疾病感兴趣的学术中心，包括临床专家和分子遗传学家。

我们的研究小组正在使用ClinGen基因:疾病临床有效性框架来评估基因与肥厚性心肌病相关的证据强度。小组成员包括具有临床和研究专长的心脏病学家和遗传咨询师，分子实验室主任和具有心脏病遗传学经验的人员，以及熟悉ClinGen临床有效性框架的策展人。

智力残疾/自闭症基因管理专家小组致力于确定致病变异明显导致智力残疾和/或自闭症的基因。基因-疾金博宝188BET网址病有效性管理过程包括描述支持特定基因-疾病关系的证据水平的分类类别:明确的、强烈的、适度的、有限的、有争议的、驳斥的和未知的疾病关系。

在第一个项目期间，我们利用线粒体疾病序列数据资源MSeqDR，重点研究了核和线粒体DNA中最常见和/或最可行的Leigh综合征、Leigh样综合征和儿科起病线粒体脑病综合征的变异致病性。我们现在专注于策划线粒体DNA变异，因为它们与原发性线粒体疾病(PMD)有关。

单基因糖尿病专家小组将制定一个可持续的过程，对致病性进行系统共识审查，并将MODY、新生儿糖尿病基因、Wolfram综合征、线粒体糖尿病和其他共识一致的综合征基因提交ClinVar。

髓系恶性肿瘤变异修复专家小组(MM-VCEP)修复与髓系恶性肿瘤遗传风险相关的基因变异。我们的小组考虑了导致终身血小板减少的基因变异(如RUNX1、ANKRD26和ETV6)以及那些只与癌症风险相关的基因变异(如GATA2、DDX41和CEBPA)。MM-VCEP与ASH合作，目前由国家癌症研究所支持。我们的目标是鼓励标准化变异管理，这将改善变异报告，并促进患者及其家属的最佳治疗。

在此制定政策的目的是鼓励和促进重要的分析，同时提供指导方针，以确保适当使用任何ClinGen联盟的数据，及时完成手稿，并遵守作者原则。

这些材料对应于2022年5月发布的ClinGen基因-疾病有效性标准操作程序第9版的更新。金博宝188BET网址支持材料中提供了版本9的更新摘要，以及突出显示更改的文档。不要求您审核这些文件，但可以协助审核标准操作程序。

ClinGen网站于2022年4月发布了几项新功能

版本3的变更总结:(1)pm5_支持无意义和移码变体的规范，这些被预测/证明会经历无意义介导的衰变(NMD)或位于最后一个已知的致病截断变体的上游[c]。2506G>T (p.Glu836Ter)]， (2) PM2_Supporting从Moderate Column到Supporting Column的柱校正。

CDH23、COCH、GJB2、KCNQ4、MYO6、MYO7A、SLC26A4、TECTA和USH2A(版本2)以及OTOF和MYO15A(版本1)ACMG/AMP变体解释指南ClinGen听力损失专家小组规范

ClinGen社区策展(C3)工作组将在2022年ACMG举办一个虚拟互动研讨会。对于已经注册过的同学，有一些东西可以在研讨会之前复习一下。

申请ClinGen专家小组地位的可用申请摘要和证明文件。

v1版本的变化:修订PS4，在所有强度水平下，RYR1中含有两个VUS/LP/P变体的个体不能被认为支持任何一种变体的致病性。， PS1可在中等水平上用于先前分类的具有相同密码子和相同氨基酸变化的可能致病变异。， PM5可以在支持水平上用于先前分类的可能的致病变异，在相同的密码子，不同的氨基酸变化。，当使用PS1或PM5时，应将PM1降级为支持。

从v1更改:修正了LP的组合规则，包括PVS1 + PM2_Supporting = LP

ClinGen网站于2022年1月发布了几项新功能

FOA建立专家小组，使用ClinGen和NCBI的ClinVar程序和基础设施。

版本2变更摘要:对影响剪接位点预测的PP3和BP4(硅预测标准)的修改，包括硅工具中用于剪接位点预测的阈值。

v1版本发布说明:新增MYOC HGNC ID，将原发性开角型青光眼(POAG)和青少年发病开角型青光眼(JOAG) (MIM: 137750)替换为原发性开角型青光眼(MONDO:0007665)和青少年开角型青光眼(MONDO:0020367)

版本说明/ v1.1的更改:更新用于澄清PM3和BP2，以及更正错字。

加入我们的组织，在2021年11月4日庆祝遗传顾问意识日。

“基因组连接西班牙同意书”

版本说明/从v2更改:更新了Glanzmann血栓症的MONDO ID从MONDO: 0010119到MONDO: 0100326

ClinGen网站于2021年10月发布了一些新功能

版本说明/从v1开始的更改:错误纠正，" p。将v1中的Leu197_Leu205del替换为p。在v1.1 Lys197_Lys205”

1级变异管理培训旨在使变异生物管理员熟悉一般的变异评估信息和ClinGen程序/资源。

2级变异策展培训旨在对生物策展人进行特定的ACMG/AMP指南规范和变异策展专家小组(VCEP)概述的变异评估程序的培训。

在此制定政策的目的是鼓励和促进重要的分析，同时提供指导方针，以确保适当使用任何ClinGen联盟的数据，及时完成手稿，并遵守作者原则。

一页信息讲义，概述参与基因组计划的情况。

ClinGen网站于2021年6月发布了几项新功能

版本说明/从v1更改:纠正格式和拼写错误(2021年4月)

ClinGen网站于2021年4月发布了几项新功能

ClinGen网站于2021年2月发布了几项新功能

参与者如何将他们的基因检测报告上传到他们的基因组网络账户的详细说明。

ClinGen网站于2021年1月发布了几项新功能

评分指标，以指导馆长评估基因证据使用ClinGen的SOP版本8。

了解更多关于GenomeConnect和C3的信息

这是一个基本的AD策划的例子，主要是从头开始的变体。

一个基本的AD管理的例子与变异分离的疾病在家庭。

一个与家族疾病分离的变异的基础AR治疗的例子。

家族中与疾病分离的变异体的基本x连锁管理的一个例子。

使用最新版本的基因-疾病临床有效性标准操作程序进行分离分析的概述。

数据提供者的进一步信息和策略

ClinGen低外显率/风险等位基因工作组关于风险等位基因和低外显率孟德尔变异分类术语的建议。

加入我们的组织，在2019年11月14日庆祝基因顾问意识日。

基因组econnect和患者数据共享计划共享数据的数据库列表。

这些材料对应于2019年8月12日发布的ClinGen基因-疾病有效性标准操作程序第7版的更新。金博宝188BET网址本文提供了版本7的更新摘要，以及高亮显示和注释的pdf版本。

我们鼓励临床医生和实验室在测试报告、患者信件和任何其他发给患者的材料中添加关于基因组连接的措辞。我们提供了不同的措辞选项，以便您选择最适合您的实践和/或实验室的措辞。

2017年冬季通讯总结了GeomeConnect参与者匹配功能，2016年的GenomeConnect报告，以及参与额外研究的选项。

2019年夏季genome econnect通讯提供了参与更新、18岁重新同意的必要性，并提供了候选基因的信息。

2018年冬季的genome econnect通讯包括遗传学的时间轴，关于外显子组和基因组的信息，并提醒参与者更新他们关于基因测试结果更新的帐户偏好!

2018年春季通讯包括关于孟德尔的信息，迄今为止的基因组网络数据共享，以及参与者如何确保他们的数据被共享!

2018年秋季的《基因组连接通讯》包括关于基因组连接参与情况的更新，关于基因组连接如何与其他注册中心合作共享数据的信息，遗传模式摘要，以及下载家庭基因检测原始数据前需要考虑的要点。

2019年冬季genome econnect通讯提供了参与更新、线粒体信息、参与者更新账户的方向和隐私考虑。

2017秋季genome econnect通讯提供了注册更新，基因测试结果类型的信息，如何庆祝家族史日，以及与genome econnect团队的基因顾问见面的机会!

2017年春季基因组连接通讯庆祝第1000位基因组连接参与者，鼓励参与者更新他们的帐户偏好，提供额外研究的信息，并强调上传您的基因检测报告的重要性。

ClinGen通过自己的患者注册中心genome econnect与患者进行数据共享已有近五年的时间。鉴于我们在基因组连接方面的经验，我们现在正与其他患者登记处合作，以实现去识别基因和健康信息的共享。

查看genome econnect同意书。如果您对参与“基因组连接”有兴趣，您可以在“基因组连接”网站上填写此同意书。

ClinGen正在努力更好地理解遗传和健康之间的关系，以改善患者护理和研究。这项工作依赖于通过数据共享收集更多信息。如果您的注册中心通过Invitae与genome econnect在同一个平台上，您的团队可以选择参加患者数据共享计划。该同意书允许ClinGen患者数据共享项目的少数成员访问参与者的注册账户，审查他们的报告，并准备用于共享的遗传和健康数据。所有共享的信息都是去识别的。作为参与数据共享的一部分，注册参与者还可以选择从ClinGen团队那里收到关于他们的基因测试结果的更新，如果我们知道他们上传的报告上的变体分类已经过时。

患者数据共享招募工具包为注册和倡导团体提供资源，这些团体正在通过患者数据共享计划共享数据。工具箱中的资源包括谈话要点、程序概述、社交媒体帖子、新闻稿语言等。

参与基因组计划的一个重要部分就是分享你的基因检测报告。这段短视频解释了如何将你的报告上传到基因组计划。

本视频介绍了患者数据共享，并提供了患者共享的基因型和表型数据如何影响变异分类的信息。

Hypothes.isis a web-based annotation tool. An SOP has been developed using standardized terms for evidence capture to augment the ClinGen Gene Clinical Validity Curation Process. This tool has been shown to reduce curation time and facilitate data transfer into the Gene Curation Interface.

ClinGen利益相关者伙伴关系工作组正在举办一个论坛，广泛吸引我们的行业利益相关者社区，为ClinGen资源的未来发展提供信息。(5月29日星期三下午3:30-5:30)

2018年2月更新。重点介绍了管理电子表格的使用方法，并对基因疾病有效性过程进行了总体说明。

我们的在线健康调查旨在捕捉参与者的整体健康状况。我们想要尽可能多地了解他们的健康，从头到脚!问题是根据身体系统(消化系统、免疫系统、心血管系统等)来组织的，参与者可以跳过任何他们觉得不舒服回答的问题。参与者被要求每年更新这个数据，或者当他们的健康状况发生变化时。此外，根据他们对本次调查的回答，如果我们需要更多关于他们具体健康问题的信息，他们可能会被要求在未来完成后续调查。

ClinGen建议重新评估先前批准的基因-疾病有效性分类。金博宝188BET网址

评分指标指导策展人评估基因证据。该版本的遗传证据评分指标用于ClinGen SOP的第7版。

临床有效性分类用于定性描述证据的强度，记录基因-疾病关联。注意:这些术语不反映可归因于某一特定基因变异的效应大小或相对风险。

简要描述原始出版物中的基因-疾病对是如何被验证的。

一旦遗传和实验证据得到评估，这个总结评分指标可以用来得出临床有效性分类。

评分指标指导策展人评估实验证据。

SOP版本5的附录B最初是作为一个单独的文档发布的。该信息包含在主SOP文件(版本6)中。

临床可操作性评估过程概述，准备于2017年2月

根据(i)结果的严重程度对特定的结果-干预组合进行评分;(ii)疾病的可能性;干预的有效性;(4)从对患者的负担和风险的角度来看，干预的性质。

最低要求的改变将于2020年1月1日生效。

ClinVar是由美国国立卫生研究院的国家生物技术信息中心(国家医学图书馆的一部分)资助和维护的一个档案。

ClinGen的资源和实践可能对NIH资助机会NOT-PM-19-001中描述的我们所有人遗传咨询资源有用。

ClinGen与学术、非营利和商业实体合作的原则。

2021年5月更新，与v1版本有所不同:澄清确认/假设是关于父母关系，而不是新生状态

ClinGen遗传性心肌病专家小组(CMP-EP)已正式加入英国临床基因组科学协会(ACGS)。

SOP第5版，2017年11月发布。

美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)之前制定了解释序列变异的指南。

SOP第4版，2017年5月发布。

临床遗传学家和参与临床护理的其他临床医生通过基因检测获得了意义不确定的变异(VUS)的患者。

请确保从ClinVar FTP站点下载最新的ClinVar提交模板。下面提供了一个示例电子表格(当前的2016年10月);与副本数量变体提交相关的字段用绿色(必需的)和浅绿色(可选的)突出显示。上传您的文件到ClinVar提交门户。如果您有任何问题，请通过clinvar@ncbi.nlm.nih.gov联系ClinVar。

总结ClinGen首席研究人员在授权数据库和数据共享方面的立场。

总结ClinGen首席研究人员在授权数据库和BRCA1/2数据共享方面的立场。

演讲由2018年罕见病基因组解读课程的博士史蒂文·哈里森(Steven Harrison)主持。

为临床实验室遗传学家提供的模块，他们参与基因组变异的解释，并积极提交变异到ClinVar数据库。该模块可通过美国医学遗传学和基因组学委员会(ABMGG)获得第四部分实践改进学分。

了解ClinGen网站上可用的功能，它利用的外部资源，以及如何引用ClinGen的工作。

提供唯一的等位基因标识符

生物策展人教育材料页面提供了生物策展人工作组关于各种主题的视频链接，以及其他有用网站和材料的链接。我们希望这些资源对您有所帮助。

干部模式为基因检测的同意和公开讨论提供支持，目的是在满足患者的社会心理和信息需求的同时，改善对基因信息的获取。

这些模块旨在为参与ClinGen策展活动的学习者提供教育学分。金宝搏188bet

该网站致力于提供关于数据交换平台、数据模型和ClinGen数据交换工作组生产的工具的最新发展和文档。

@ClinGenResource -在这里你可以随时了解ClinGen正在发生的事情，也可以跟踪我们发现的有趣的事情。

2021年6月24日至6月25日为期两天的虚拟研讨会的讲座和录音。

有兴趣志愿为策展工作，参加我们的调查!请告诉我们更多您的兴趣、专业知识和期望的参与程度，以便我们为您安排合适的策划活动和/或专家小组。

在这里，您可以了解ClinGen开发或共享的网络研讨会、演讲、培训视频和其他视频资源的最新情况。

临床行动工具支持的管理过程是识别那些人类基因，当显著改变时，会带来严重疾病的高风险，如果风险已知，可以预防或减轻。该界面目前仅限于临床行动策展人使用。

广泛数据共享的同意模板

录音从多部分，在基因组学的各种职业的虚拟小组系列。

查看符合数据共享最低标准的临床实验室列表

用于研究不同粒度级别的ClinVar数据的工具

一个由多部分组成的网络系列，旨在教育社区关于最新发布的ACMG/ClinGen技术标准，用于解释和报告宪法拷贝数变异(CNVs)。

ClinGen标准规范(CSpec)注册表是一个集中的数据库，旨在管理和维护由ClinGen变种管理专家小组定义的ACMG变种致病性分类的标准规范证据代码。CSpec注册中心支持以结构化的、机器可读的格式存储VCEP标准规范。

ClinGen剂量敏感性工具有助于收集支持/驳斥基因和基因组区域单倍不足和三倍敏感的证据的管理过程。该界面目前仅限于剂量敏感性管理员使用。

专家对变异致病性的解释。

GenCC数据库汇总了由GenCC成员组织提交的与基因-疾病关系有效性相关的信息。

ClinGen的基因疾病临床有效性工具支持评估支持或驳斥某一特定基因变异导致某一特定疾病的证据强度。该界面目前仅限于基因策展的策展人使用。

查看符合最低标准的基因组分析软件平台列表，以支持数据共享

ClinGen之外的基因组学资源的全面列表，以及关于如何利用Open InfoButton的信息。

2021年2月3日至2月5日，为期三天的虚拟研讨会的讲座和录音。

2022年4月6日至4月8日，虚拟研讨会的讲座和录音

如何与ClinVar分享你实验室或诊所的不同解读和支持性观察。

ClinGen Linked Data Hub (LDH)促进了对排序信息的有效访问，例如链接和从不同数据源选择数据，这些信息可以使用RESTful api提供。目前，LDH专注于链接关于人类基因和变异的信息，以支持ClinGen的管理工作。

了解一个模块对第四部分实践改进临床实验室遗传学家。

输入ACMG-AMP证据标签生成分类

了解患者和患者团体通过genome econnect和其他工具共享数据的过程。

ClinGen认为共享变异解释对于支持基因组医学至关重要，也是保证准确的基因和基因组检测质量的关键部分。

面向临床实验室遗传学家第四部分实践改进的模块。

在循证框架内用于序列变异解释的工具。该接口可供公众使用。