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临床基因组资源(ClinGen)序列变异解释工作组开始完善美国医学遗传和基因组学学院和分子病理学家协会(ACMG/AMP)对独立规则BA1(一种具有较小等位基因频率[MAF] > 0.05为良性的变异)的变异致病性建议，明确了它应该如何使用，并指定了一组应不受该规则限制的变异。我们交叉引用了ClinVar和外显子组聚集联盟的数据，以确定那些在MAF > 0.05处存在于一个或多个种群数据集中且具有致病力的变异。我们在这些数据集中发现了9种可能不是良性的变异。ACMG/AMP标准被应用于这些导致4个致病变异和5个不确定意义变异的变异。通过澄清用于描述其使用的术语、建议使用的数据库以及对该规则的假设，我们对良性规则BA1进行了改进。我们还发现了一个最初的9个变体列表，尽管这些变体的MAF很高，但仍有一些致病的证据。我们指定了个体可以向ClinGen请求修改我们的变异特异性断言的过程，以及专家在为特定基因设置较低的BA1阈值时应使用的标准。