文件和公告
临床基因组资源(ClinGen)家族性高胆固醇血症变体管理专家小组对LDLR变体分类的共识指南
Joana R. Chora, Michael A. Iacocca, Lukáš Tichý， Hannah Wand。C. Lisa Kurtz、Heather Zimmermann、Annette Leon、Maggie Williams、Steve E. Humphries、Amanda J. Hooper、Mark Trinder、Liam R. Brunham、Alexandre Costa Pereira、Cinthia E. Jannes、Margaret Chen、Jessica Chonis、Wang Jian、Serra Kim、Tami Johnston、Premysl Soucek、Michal Kramarek、Sarah E. Leigh、Alain Carrié、Eric J. Sijbrands、Robert A. Hegele、Tomáš Freiberger、Joshua W.Knowles、Mafalda Bourbon代表ClinGen家族高胆固醇血专家小组。
目的
2015年，美国医学遗传与基因组学会(ACMG)和分子病理学协会(AMP)发布了孟德尔病序列水平变异分类的共识标准化指南。为了提高准确性和一致性，临床基因组资源家族性高胆固醇血症(FH)变体管理专家小组的任务是优化现有的ACMG/AMP框架，用于FH的疾病特异性分类。在这项研究中，我们为最常见的fh相关基因提供了共识建议，LDLR，其中>2300独特的fh相关变种已被确定。
方法
多学科的跳频变体策划专家小组面对面、通过频繁的电子邮件和电话会议进行开发LDLR- ACMG/AMP指南的具体修改。通过迭代、试点测试、辩论和评论，专家们达成了共识。
结果
的共识LDLR对现有ACMG/AMP指南的变体修改包括(1)群体频率阈值的改变，(2)功能缺失变体类型的描述，(3)功能研究标准规范，(4)共分离标准规范，以及(5)硅预测工具的具体使用和阈值等。
结论
将这些指南作为临床实验室设置的新标准，将产生一种更加循证、协调的方法LDLR不同的分类，从而改善了对FH患者的护理。